Посёлок в составе Колпинского района города федерального значения Санкт-Петербурга, расположен на левом берегу Невы, восточнее поселка Понтонный, западнее устья реки Тосны, севернее линии Северной железной дороги. Назван по Императорскому Сапёрному батальону, лагерь которого находился здесь во 2-й половине XIX века, давший также название проходящему в посёлке Лагерному шоссе.

ГЕРБ поселка Саперный принят в 2012 году.
Два золотых топора накрест, изображенных на знаке, символизируют название поселка Саперный. В дореволюционное время, в начале XX века, этот символ являлся эмблемой инженерных войск России. Лазоревый цвет (лазурь) – символ реки Невы, на берегу которой расположен поселок Червлень (красный) и золото – геральдические цвета Санкт_Петербурга, напоминающие о гербе и флаге Санкт_Петербурга, символ вхождения муниципального образования в состав Санкт_Петербурга. Две золотые лавровые ветви, положенные накрест поверх сечения, – славное историческое прошлое поселка, напоминание об известных владельцах этих земель в старину – Корчмине и Шереметьеве.
ФЛАГ Утвержден Решением Муниципального Совета муниципального образования поселок Саперный от 20 февраля 2012 года. Прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине - 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования поселок Саперный в красном, синем и желтых цветах.
История поселка берет свое начало с 1710 года, когда земли современных поселков Понтонный и Саперный, отвоеванные в ходе Северной войны, были пожалованы генерал-майору Василию Дмитриевичу Корчмину. В их восточной части, в 1 км от устья реки Тосны, образовалась деревня Новая. В 1743 году владельцем бывшего имения Корчмина стал П. Г. Шереметев. Восточнее имения создается мыза Шереметева.
Территория относилась к Ивановской волости Шлиссельбургского уезда Санкт-Петербургской губернии.
К крестьянской реформе 1861 года в деревне Новой проживал 71 крестьянин мужского пола.
В XIX в. Шереметевы сдавали земли в аренду. Крупнейшим арендатором стало Главное Инженерное Управление. Земли предназначались «для устройства лагерей и учебных плацев, для практических саперных, как подземных, так и минных работ, и всякого рода стрельб». 22 июля 1867 года было одобрено предложение о переносе лагеря Сводной саперной бригады и роты юнкеров Николаевского Инженерного училища из окрестностей Петергофа к селу Вознесенскому и расположении совместно с ними одной пешей артиллерийской бригады из числа находящихся в Петербургском военном округе. Так в 1868 году началось строительство Усть-Ижорского Саперного лагеря (лагеря лейб-гвардии Саперного батальона), распланированного по прямоугольной схеме и развернутого по оси север-юг на берегу р. Невы восточнее села Корчмино. Была проведена новая дорога из Царского Села через Колпино к берегу Невы на случай приезда императора (совр. Лагерное шоссе). Лагерь окружали полигоны, прорезанные дорогами, с устроенными позициями и учебными фортификационными сооружениями. Были построены казармы по проекту архитектора А.К. Монтага и солдатское жилье из палаток в отрытых котлованах прямоугольной формы. В 1899 году в центре Саперного лагеря была построена и освящена деревянная церковь во имя Святого равноапостольного князя Владимира, которая вмещала около 350 человек.
Прекрасное устройство лагеря и наличие сообщения с Царским Селом способствовали возможности периодически устраивать Высочайшие смотры войскам Усть-Ижорского лагеря. Император Николай II неоднократно посещал лагерь, в т. ч. с зарубежными гостями.
В дневнике Николая II осталось такое описание его посещение лагеря 24 августа 1895 года: «В 9.15 при отличной погоде отправился в Усть-Ижору... Приехал в Колпино в 10.45 и поехал в коляске к полигону, где стоял почётный караул от Лейб—Гвардии Сапёрного батальона. Посмотрев стрельбу из осадных орудий, начал объезд ... всех работ лагеря этого лета. Многое из того, что я видел, было показано два года тому назад, но много было также и нового. Очень практичны мосты Мейскера для переносных железных дорог. На берегу Невы и в самой реке было сделано много взрывов и фугасов, а также камнемётов. На пароходе «Инженер» спустились к понтонному мосту. Оттуда проехал мимо лагеря на станцию».

В 1906 году было открыто движение по Северной железной дороге. Рядом с платформой Саперная возникает небольшой станционный поселок.
После Октябрьской революции 1917 года лейб-гвардии Саперный батальон был расформирован. Территория саперного лагеря опустела.
В 1935 году невдалеке от поселка началось строительство завода по производству технических спиртов (Ленспиртстрой).
Во время Великой Отечественной войны наступавшие на Ленинград немецкие войска 31 августа взяли деревню Новая, но уже 2 сентября она была освобождена частями 4-й дивизии народного ополчения.
В здании завода размещались штаб 55-й армии, штабы других частей, госпиталь. В августе 1942 года территория вблизи завода стала местом проведения Усть-Тосненской операции. Здание было разрушено (его руины сохранились, использовались как съемочная площадка Ленфильма). В 1997 году поисковиками здесь были обнаружены останки погибших, произведено их захоронение, и вскоре был установлен мемориал. Сейчас эта территория относится к в/ч 20570 Ленинградской военно-морской базы.
В 1950-1960-е годы рядом со станцией строятся индивидуальные жилые дома. Восточнее в 1963 году введен в строй Ленинградский мебельный комбинат № 1. С поселком сливается и становится его восточной частью территория бывшей деревни Новая.
По решению Ленгорисполкома от 28 октября 1964 года были объединены деревни Корчмино, поселок Лендинас, городок Свирьстрой, городок Горвод, городок Электросталь и поселок при станции Саперная в один поселок с присвоением ему названия Саперный. Он был отнесен к категории рабочих поселков (без образования поселкового совета, функции которого были переданы Понтонному поссовету).
По данным Всесоюзной переписи населения в 1970 году в Саперном проживало 2 066 человек. В дальнейшем численность уменьшалась, главным образом, за счет миграции, и в 1989 году число жителей составило 1 032 - вдвое меньше.
В 1997 году создано муниципальное образование поселок Саперный. В 2002 году в Саперном проживало 1 401 человек, по предварительным результатам Всероссийской переписи населения 2010 года — 1 454. В поселке девять малоэтажных домов (3-5 этажей).
От бывшего саперного лагеря со временем следов не осталось. Территория, на которой когда-то находился лагерь, покрыта зарослями деревьев и кустарника; чуть подальше находятся небольшие садовые домики. Рядом с дорогой, в районе бывшей лагерной церкви, устроен стадион «Парус». В поселке был открыт дом культуры.
Самым крупным предприятием в поселке является мебельная фабрика «Балтика-мебель», созданная в 1996 году на территории Ленинградского мебельного комбината № 1. На территории поселка находится водонасосная станция ГУП «Водоканал» и газораспределительная станция, введенная в 1995 году.